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Registro Completo |
Biblioteca(s): |
Epagri-Sede. |
Data corrente: |
08/09/2015 |
Data da última atualização: |
08/09/2015 |
Tipo da produção científica: |
Artigo em Periódico Indexado |
Autoria: |
CUNHA, C. M. S.; HINZ, R. H.; PEREIRA, A.; TCACENCO, F. A.; PAULINO, E. C.; STADNIK, M. J. |
Título: |
A SCAR marker for identifying susceptibility to Fusarium oxysporum f. sp. cubense in banana. |
Ano de publicação: |
2015 |
Fonte/Imprenta: |
Scientia Horticulturae, British Columbia, v. 191, p. 108-112, 2015. |
Idioma: |
Inglês |
Conteúdo: |
Fusarium wilt (also known as Panama disease) caused by Fusarium oxysporum Schlechtend.
f. sp. cubense (E.F. Smith) W.C. Snyder & H.N. Hansen (Foc) is an endemic disease in all banana (Musa
spp. L.) producing areas. The use of resistant cultivars is the recommended method for the disease
control. The development of resistant or tolerant cultivars is expensive and time-consuming since the
results must be confirmed by many years of field evaluation. In this situation, DNA markers show a
great potential to improve the efficiency and precision of conventional plant breeding. Thus, the
objective of this work was to develop a SCAR marker able to discriminate between resistant and
susceptible genotypes to Foc infection. Using genomic DNA from resistant or susceptible genotypes
and 78 10-mer arbitrary primers, one RAPD band associated to susceptibility was selected and used to
generate the SCAR marker SuscPD-F/SuscPD-R. This marker was validated on 28 banana cultivars
which were resistant or susceptible to infection by Foc. The results indicated a high degree of
specificity of the marker, which was able to discriminate between the two contrasting groups
(resistant or susceptible). The discriminatory power of the new marker was 93%. |
Palavras-Chave: |
molecular marker; Panama disease. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
LEADER 01864naa a2200205 a 4500 001 1124373 005 2015-09-08 008 2015 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aCUNHA, C. M. S. 245 $aA SCAR marker for identifying susceptibility to Fusarium oxysporum f. sp. cubense in banana.$h[electronic resource] 260 $c2015 520 $aFusarium wilt (also known as Panama disease) caused by Fusarium oxysporum Schlechtend. f. sp. cubense (E.F. Smith) W.C. Snyder & H.N. Hansen (Foc) is an endemic disease in all banana (Musa spp. L.) producing areas. The use of resistant cultivars is the recommended method for the disease control. The development of resistant or tolerant cultivars is expensive and time-consuming since the results must be confirmed by many years of field evaluation. In this situation, DNA markers show a great potential to improve the efficiency and precision of conventional plant breeding. Thus, the objective of this work was to develop a SCAR marker able to discriminate between resistant and susceptible genotypes to Foc infection. Using genomic DNA from resistant or susceptible genotypes and 78 10-mer arbitrary primers, one RAPD band associated to susceptibility was selected and used to generate the SCAR marker SuscPD-F/SuscPD-R. This marker was validated on 28 banana cultivars which were resistant or susceptible to infection by Foc. The results indicated a high degree of specificity of the marker, which was able to discriminate between the two contrasting groups (resistant or susceptible). The discriminatory power of the new marker was 93%. 653 $amolecular marker 653 $aPanama disease 700 1 $aHINZ, R. H. 700 1 $aPEREIRA, A. 700 1 $aTCACENCO, F. A. 700 1 $aPAULINO, E. C. 700 1 $aSTADNIK, M. J. 773 $tScientia Horticulturae, British Columbia$gv. 191, p. 108-112, 2015.
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Registro original: |
Epagri-Sede (Epagri-Sede) |
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Biblioteca |
ID |
Origem |
Tipo/Formato |
Classificação |
Cutter |
Registro |
Volume |
Status |
|
Voltar
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Registro Completo
Biblioteca(s): |
Epagri-Sede. |
Data corrente: |
27/02/2014 |
Data da última atualização: |
27/02/2014 |
Autoria: |
NUNES, E. C. |
Título: |
Caracterização físico-química do amido e cultura de células e tecidos vegetais como ferramentas biotecnológicas à seleção e conservação de germoplasma de mandioca de mesa (Manihot esculenta Crantz). |
Ano de publicação: |
2013 |
Fonte/Imprenta: |
Florianópolis, 2013. |
Páginas: |
167 p. |
Idioma: |
Português |
Conteúdo: |
A mandioca de mesa (Manihot esculenta Crantz) é nativa da América sendo produzida em condições adversas de solo e clima, com muitas aplicações para a alimentação humana e para extração de amido. É considerada a terceira maior fonte de carboidratos consumidos no mundo, com importância social significativa, especialmente em países tropicais. No Estado de Santa Catarina (Sul do Brasil), é produzida como cultura de subsistência por agricultores familiares que conservam em suas propriedades (on farm) inúmeros materiais genéticos. Muitos destes materiais estão depositados no banco de Germoplasma da Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural-Epagri, integrando a coleção de trabalho do seu programa de melhoramento genético. Estes acessos genéticos, bem como os obtidos através de cruzamentos estão sendo avaliados principalmente para características morfo- agronômicas. Todavia existe necessidade de informações detalhadas sobre estes materiais genéticos para definir uma melhor aplicabilidade destes acessos de mandioca. Neste contexto os principais objetivos deste trabalho foram a caracterização físico-química do amido de 40 acessos de mandioca e de cultura de células e tecidos vegetais, buscando desenvolver ferramentas de auxílio à seleção e de conservação de germoplasma desses materiais. Para a caracterização físico-química o amido e suas frações (amilose e amilopectina) dos acessos genéticos foram analisados, por métodos analíticos típicos de uma plataforma metabolômica, i.e. ATR-FTIR, UV-vis e DRX, associados às ferramentas de quimiometria e bioinformática. Os principais resultados alcançados foram: Os acessos AO- 89, AO- 118, AR- 53, AO- 72, AO- 79 apresentaram alto teor de amilose. Os perfis espectrais ATR- FTIR obtidos associados a ferramentas quimiométricas agruparam os acessos AO- 13 , AO- 109, AO- 118 e AO- 121 por apresentaram uma composição química peculiar em relação aos demais. Em relação à cultura e conservação in vitro, o meio de cultura (MS semi-sólido + 4 % de sacarose e 0,01 mg/l de BAP) se mostrou adequado para a micropropagação de mandioca, enquanto o meio de cultura MS semi-sólido + 8 % de sacarose permitiu a manutenção de culturas viáveis durante um período de 12 meses, sem a necessidade de sub-cultura. MenosA mandioca de mesa (Manihot esculenta Crantz) é nativa da América sendo produzida em condições adversas de solo e clima, com muitas aplicações para a alimentação humana e para extração de amido. É considerada a terceira maior fonte de carboidratos consumidos no mundo, com importância social significativa, especialmente em países tropicais. No Estado de Santa Catarina (Sul do Brasil), é produzida como cultura de subsistência por agricultores familiares que conservam em suas propriedades (on farm) inúmeros materiais genéticos. Muitos destes materiais estão depositados no banco de Germoplasma da Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural-Epagri, integrando a coleção de trabalho do seu programa de melhoramento genético. Estes acessos genéticos, bem como os obtidos através de cruzamentos estão sendo avaliados principalmente para características morfo- agronômicas. Todavia existe necessidade de informações detalhadas sobre estes materiais genéticos para definir uma melhor aplicabilidade destes acessos de mandioca. Neste contexto os principais objetivos deste trabalho foram a caracterização físico-química do amido de 40 acessos de mandioca e de cultura de células e tecidos vegetais, buscando desenvolver ferramentas de auxílio à seleção e de conservação de germoplasma desses materiais. Para a caracterização físico-química o amido e suas frações (amilose e amilopectina) dos acessos genéticos foram analisados, por métodos analíticos típicos de uma plataforma metabolômica, i.e. ... Mostrar Tudo |
Palavras-Chave: |
Caracterização fisicoquímica; Conservação in vitro; Mandioca; Manihot esculenta; Micropropagação; Quimiometria. |
Categoria do assunto: |
F Plantas e Produtos de Origem Vegetal |
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Marc: |
LEADER 02998nam a2200193 a 4500 001 1120241 005 2014-02-27 008 2013 bl uuuu m 00u1 u #d 100 1 $aNUNES, E. C. 245 $aCaracterização físico-química do amido e cultura de células e tecidos vegetais como ferramentas biotecnológicas à seleção e conservação de germoplasma de mandioca de mesa (Manihot esculenta Crantz). 260 $aFlorianópolis$c2013 300 $a167 p. 520 $aA mandioca de mesa (Manihot esculenta Crantz) é nativa da América sendo produzida em condições adversas de solo e clima, com muitas aplicações para a alimentação humana e para extração de amido. É considerada a terceira maior fonte de carboidratos consumidos no mundo, com importância social significativa, especialmente em países tropicais. No Estado de Santa Catarina (Sul do Brasil), é produzida como cultura de subsistência por agricultores familiares que conservam em suas propriedades (on farm) inúmeros materiais genéticos. Muitos destes materiais estão depositados no banco de Germoplasma da Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural-Epagri, integrando a coleção de trabalho do seu programa de melhoramento genético. Estes acessos genéticos, bem como os obtidos através de cruzamentos estão sendo avaliados principalmente para características morfo- agronômicas. Todavia existe necessidade de informações detalhadas sobre estes materiais genéticos para definir uma melhor aplicabilidade destes acessos de mandioca. Neste contexto os principais objetivos deste trabalho foram a caracterização físico-química do amido de 40 acessos de mandioca e de cultura de células e tecidos vegetais, buscando desenvolver ferramentas de auxílio à seleção e de conservação de germoplasma desses materiais. Para a caracterização físico-química o amido e suas frações (amilose e amilopectina) dos acessos genéticos foram analisados, por métodos analíticos típicos de uma plataforma metabolômica, i.e. ATR-FTIR, UV-vis e DRX, associados às ferramentas de quimiometria e bioinformática. Os principais resultados alcançados foram: Os acessos AO- 89, AO- 118, AR- 53, AO- 72, AO- 79 apresentaram alto teor de amilose. Os perfis espectrais ATR- FTIR obtidos associados a ferramentas quimiométricas agruparam os acessos AO- 13 , AO- 109, AO- 118 e AO- 121 por apresentaram uma composição química peculiar em relação aos demais. Em relação à cultura e conservação in vitro, o meio de cultura (MS semi-sólido + 4 % de sacarose e 0,01 mg/l de BAP) se mostrou adequado para a micropropagação de mandioca, enquanto o meio de cultura MS semi-sólido + 8 % de sacarose permitiu a manutenção de culturas viáveis durante um período de 12 meses, sem a necessidade de sub-cultura. 653 $aCaracterização fisicoquímica 653 $aConservação in vitro 653 $aMandioca 653 $aManihot esculenta 653 $aMicropropagação 653 $aQuimiometria
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